Bioinformatics Databases (2) 썸네일형 리스트형 AlphaFold Protein Structure Database 오픈! 오늘자 딥마인드 블로그에서 새 버전의 알파폴드, 그리고 알파폴드로 예측된 단백질 구조 데이터베이스가 오픈되었다는 소식이 올라왔어요. 단백질은 생물체 내에서 합성되어 생물체의 물질대사에 관여하는 물질이므로 단백질 구조를 아는 것은 기본적으로 생물체 내에서의 메커니즘 연구에 중요합니다. 또 그 대사 과정에서 분해, 약물반응 등의 작용등을 생물체 밖에서 활용하는 연구들이 다양하게 이루어지고 있다 보니 이번 디비 공개를 통해 플라스틱의 생 분해 연구, 항생제 저항성 연구 등 현실 세계에서의 다양한 문제들을 해결하는 데에도 활용될 것이라고 갈무리하고 있어요. 유전체의 염기서열 - 아미노선 서열을 안다고 해도 단백질 구조 예측은 또 다른 차원의 문제여서 유전체 데이터의 확보와 비례하지 않는 속도로 연구나 데이터 축.. DGV: Database of Genomic Variants DGV 개요 comprehensive summary of structural variation in the human genome SV = 50bp 이상 이라고 정의함 healthy control sample 로부터 얻어진 variant 만 수집함 control data의 useful catalog 로 표현형과 변이 사이의 상관관계 연구에 활용할 수 있는 Genomic variant database 지속적인 업데이트 수행 DGV 에서의 variant 처리 과정 샘플 레벨로 세출되는 변이에 대해서 유사한 boundary 를 가지는 경우 merge 수행 (동일한 type 인 경우, 동일한 platform-approach 통해서 만들어진 경우에만) merge 수행 시 overlap thershold: reci.. 이전 1 다음
