분류 전체보기 (69) 썸네일형 리스트형 인간 참조 범유전체 발표 관련 기사 공유 https://www.nih.gov/news-events/news-releases/scientists-release-new-human-pangenome-reference Scientists release a new human “pangenome” reference More complete and sophisticated collection of genome sequences captures significantly more human diversity. www.nih.gov 새로운 인간 참조 범유전체가 완성되었다는 소식입니다. 부제로는 보다 완성된, 또한 복잡한 유전체 시퀀스의 집합을 통해 인간 유전체의 다양성을 확보할 수 있다는 언급이 되어있습니다. 새로운 참조범유전체(Pangenome)은 47명의 인.. 생물정보학 혼자 시작할 때 좋은 온라인 자료 2022 어드메 페북에서 본 정보인데 (장혜식 님 페이스북) 널리널리 퍼뜨리고 싶어서 링크 올립니다요. 내용 그대로 올리는건 좀 아닌거같아서.. 타고 들어가 보시라고 ... 생물정보학 요새 인기 많은가 ? .. 내가 보는 사이트 검색팁도 정리해서 올려야징. https://www.facebook.com/hyeshik/posts/pfbid02vHajdRoXLi7zWqe35LN1EEGNtqBq3mcaKcYgMdYAgkfPY9nbK84AZV3BSHkPAdRBl 로그인 또는 가입하여 보기 Facebook에서 게시물, 사진 등을 확인하세요. www.facebook.com Support Vector Machine 본 글은 An Introduction to Statistical Learning의 9 Support Vector Machines 챕터를 정리한 것입니다. SVM Classification approach : Maximal Margin Classifier의 generalized version Maximal Margin Classifier: Linear boundary 필요로 함: 모든 데이터셋에 적용 어려워 Support Vector classifier: MMC의 확장판ㅡ 보다 다양한 데이터들을 다룰 수 있게 됨 Support Vector Machine: SVC의 확장, non-linear class boundary 또한 다룰 수 있게 됨 9.1 Maximal Margin Classifier 9.1.1 W.. 복제수변이(Copy Number Variants) 이해하기 복제수변이는 인간의 유전체 상에 발생할 수 있는 구조변이 (Structural Variants, seqeunce variants와 구별됨) 중 한 종류로 특정한 DNA segment에 대해 duplication 혹은 deletion이 발생되어 해당 segment의 유전체 내에서의 copy number에 변화가 생긴 것을 의미한다. 인간의 경우 엄마, 아빠로부터 난자, 정자가 결합하여 수정란이 만들어지고, 그 수정란의 발생으로 인간 개체가 형성되므로 유전체 상의 어떤 임의의 지역을 살펴본다고 가정했을 때, 그 지역은 copy number 2를 가지는 것이 일반적이다(repeat 등의 다른 유전체 상의 element를 고려하지 않음). 그러나 생물체의 유전체 내에서는 지속적으로 크고 작은 변이가 발생하는데 .. Linear Model Selection and Regularization 본 글은 An Introduction to Statistical Learning의 Chapter 6. Linear Model Selection and Regularization 을 정리한 것입니다. 목차 1. Introduction 2. Subset selection 2.1. Best subset selection 2.2. Stepwise selection 2.3 Choosing the Optimal model 3. Shrinkage method 3.1. Ridge regression 3.2. The Lasso 3.3. Selecting tuning parameter 4. Dimension reduction 4.1. Principal component Regression 4.2. Partial least.. 2.8분기 회고-개강일기를 곁들인- 회고를 쓰게 된 배경 상반기 회고란 말이 무색하게 하반기의 1/3이 지나버렸고, 더불어 지난주에는 개강도 했다. 종강 개강 의미가 무색해진 직장인 주변인들을 만나 이야기하기엔 새삼스러운데, 대학원이란 환경이 있다 보니 새 출발 따위의 의미를 부여하기 나쁘지 않은 시기이기도 하다. 마감이 가까워진 마당에 주중에 적당한 글감을 정하지 못한 상태에서 주말 오후를 복습에 날려버린 이 시점에 쉽게 선택할 수 있는 대안이 이기도 하고. 그 지나가버린 시간은 작성하는 사람이 의미 부여하기 나름이니까. 최근의 이벤트 올 초? 비교적 이른 시기에 사촌동생이 결혼을 준비하고 있다며 식사와 술을 대접한 자리가 있었는데, 그때까지만 해도 원래 이렇게 청첩장 모임을 일찍 갖던가? 하는 생각을 했었는데, 그 긴 기간이 어느새 훌.. 뱅크샐러드 유전자 검사 결과 뜯어보기 뱅크샐러드 앱에서 언젠가부터 무료 유전자검사 서비스를 제공하고 있다. 나는 진작에 신청이 되어서 몰랐는데 최근까지도 계속 검사가 진행되고 있는 것으로 보아 뱅샐 이용자 중 꽤 많은 이들이 이 검사를 받지 않았을까 하는 생각이 든다. 유전자 검사 자체는 마크로젠에서 이루어지고, 뱅크샐러드가 중간에서 선착순 신청을 받아 검사기관으로 연결 -> 검사 결과를 받아 개인 어플리케이션에 올리는 작업을 하는 것으로 보인다. (*그래서 검사 이후에 앱을 통해서 유전자 기반의 질병 발생 확률 정보를 확인할 수 있다.) 사실 나는 이 유전자 검사 서비스의 실효성과... 이 검사를 무료로 제공하는 것의 저의에 대한 의심을 은은하게 가지고 있는 사람인데 (뱅크샐러드 유전자 검사 왜 하는거야? 라는 제목의 넋두리 글을 쓴 과.. 피어리뷰 한 리뷰 1. 모 저널에서 리뷰 요청이 왔다. IF가 높다고 하긴 어렵지만 나름 유명한 저널의 자매지인데 (친자매는 아니고 사촌지간쯤 되지 않을까..) 왜 PI급도 아니고 이렇다 할 주저자 논문도 없는 내게..? 1-1. 심지어 그것도 내가 메일을 늦게 확인하는 동안 1주일이 지나서 reminder 메일까지 왔다. 그때 발견한 것(..) 2. 호기심, 의아함, 왠지 재밌을 것 같다, 각잡고 비판적으로 논문을 읽을 수 있는 기회! (..)라고 생각해서 교수님께 라이트 하게 여쭤는 보고 냉큼 accept 눌러버렸다. 3. 속마음은 사실 (1) 지금 내가 남 논문 리뷰하고 앉아있을 때가 아닌데... (얼른 논문 쓰고 내 거 해야 함) (2) 내가 남 연구 이래라저래라 왈가왈부할 짬이 되나... (ㅋ) 였지만 뭐 이렇게.. AlphaFold Protein Structure Database 오픈! 오늘자 딥마인드 블로그에서 새 버전의 알파폴드, 그리고 알파폴드로 예측된 단백질 구조 데이터베이스가 오픈되었다는 소식이 올라왔어요. 단백질은 생물체 내에서 합성되어 생물체의 물질대사에 관여하는 물질이므로 단백질 구조를 아는 것은 기본적으로 생물체 내에서의 메커니즘 연구에 중요합니다. 또 그 대사 과정에서 분해, 약물반응 등의 작용등을 생물체 밖에서 활용하는 연구들이 다양하게 이루어지고 있다 보니 이번 디비 공개를 통해 플라스틱의 생 분해 연구, 항생제 저항성 연구 등 현실 세계에서의 다양한 문제들을 해결하는 데에도 활용될 것이라고 갈무리하고 있어요. 유전체의 염기서열 - 아미노선 서열을 안다고 해도 단백질 구조 예측은 또 다른 차원의 문제여서 유전체 데이터의 확보와 비례하지 않는 속도로 연구나 데이터 축.. [M1 Mac] VSCode 설치 M1 mac 사용하면서는 새로 프로그램 받을 때 마다 M1 mac [프로그램 이름] 이렇게 찾아보는 편이다. https://code.visualstudio.com/ Visual Studio Code - Code Editing. Redefined Visual Studio Code is a code editor redefined and optimized for building and debugging modern web and cloud applications. Visual Studio Code is free and available on your favorite platform - Linux, macOS, and Windows. code.visualstudio.com 첫 화면에서 만나게 되는 설치 버튼은 .. 이전 1 2 3 4 ··· 7 다음
