본문 바로가기

반응형

전체 글

(69)
DeepLGP: a novel deep learning method for prioritizing lncRNA target genes lncRNA Long non-coding RNA로 200nt 이상의 길이를 가지는 긴 RNA 분자이면서 단백질로 번역되지 않는 RNA를 의미한다. 생물체 내에서 lncRNA는 다양한 조절 기전에 참여하여 작용하는 것으로 밝혀졌는데, 다양한 조절 기전들은 다음과 같다. - Chromosomal silencing (염색체 침묵, 염색체 자체가 비활성화되는 작용) - Genomic imprinting (유전자 각인, 유전자의 발현 조절이 부모로부터의 원인에 의해 이루어지는 후성유전학적 현상) - Chromatin modification (염색질 구조 변형) - Transcriptional activation (전사 활성) - Transcriptional interference (전사 저해) - Nuclear ..
진화 연구가 하고싶긴 한 거야? 가만 보면 블로그 이름에도 이볼루션 어쩌고... 하고 있는데 대체 무슨 일일까? 계기가 있었나. 아주 없었던 것 같지는 않은데... 그리고 그 과거에는 나름 명분도 있고 열정도 있었는지 모르겠지만 어쩌면 지금은 각종 과제 수행을 위한 연구에 치이고 졸업은 또 언제하지 치이고 나서 헐 내거는 또 언제하지 하며 덩그러니 있는 내 개인과제를 절반은 안쓰러운 눈으로 절반은 맹목으로 바라보고 있는 나.. 스스로에게도 민망하지만서도 그럴싸하게 앵무새처럼 떠들고 있었던 게지. 누가 졸업 언제 하냐 물으면 짜증 낼 줄이나 알았지, 어렴풋한 상상 외에 커리어를 진지하게 고민해본 적은 없었던 것 같은데 어렴풋한 상상을 -거의 날 것 그대로- 남들 앞에 처음 내어놓는 경험을 하고 나니 이런 저런 생각이 들었다. 먼 미래라고..
FIMO: Find Individual Motif Occurrences 모티프 (Motif)는 유전체 내에서 생물학적 기능에 기여하는 짧은 DNA 서열이다. 생물체의 성장, 유지, 번식을 위해서 세포 수준에서 다양한 조절과정이 수반되고 그 조절과정에는 다수의 단백질이 관여한다. 단백질은 다양한 형태로 유전자의 발현 및 번역 과정을 조절하는데, 그 중 한 가지 방법은 DNA분자에 직접 결합하는 것이다. 단백질은 DNA 분자에 직접 결합함으로써 새로운 결합이나 다른 작용을 유발하거나, 억제함으로써 유전자의 발현을 조절한다. 이러한 과정에 참여하는 단백질을 Trnascription factor (TF, 전사인자) 라고 통칭하는데, 당연하게도 DNA의 아무 위치에 결합해서는 의도한 조절작용을 나타낼 수 없다. TF가 인식하여 부착하는 DNA의 염기서열을 찾은 것이 motif이고, ..

반응형